Мотивы в белке CYNS_ECOLI, описанные в БД Prosite

В базе данных PROSITE нашла все мотивы в последовательности моего белка (cyns_ecoli). Специфичных последовательностей найдено не было. Результаты поиска по неспецифичным мотивам приведены ниже:

Идентификатор документа PROSITE (AC)	Название мотива	Краткое описание мотива	Тип подписи (паттерн, профиль)	Паттерн (регулярное выражение)	Специфична ли подпись?	Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00006	CK2_PHOSPHO_SITE	Casein kinase II phosphorylation site (сайт фосфоилирования киназы казеина)	паттерн	[ST] - x(2) - [DE]	неспецифична	1
PS00008	MYRISTYL	N-myristoylation site (Сайт N-миристоилирования)	паттерн	G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P}	неспецифична	4
PS00029	LEUCINE_ZIPPER	Leucine zipper pattern	паттерн	L - x(6) - L - x(6) - L - x(6) - L	неспецифична	1
PS00007	TYR_PHOSPHO_SITE	Tyrosine kinase phosphorylation site (сайт фосфорилирования киназы тирозина )	паттерн	[RK] - x(2) - [DE] - x(3) - Y or [RK] - x(3) - [DE] - x(2) - Y	неспецифична	1
PS00005	PKC_PHOSPHO_SITE	Protein kinase C phosphorylation site (сайт фосфорилирования протеинкиназы C)	паттерн	[ST] - x - [RK]	неспецифична	1

В данном задании я хотела найти, есть ли в моем белке такие особенные участки последовательности, которые специфичны для него, либо белков, похожих и обладающих сходными с ним функциями. Эти последовательности, по-видимому, должны обеспечивать такую пространственную структуру (а точнее играть важную роль в этом), которая позволяет выполнять эту функцию. Специфичных мотивов в баз данных обнаружено не было. Это можно объяснить либо недостаточной изученностью моего белка, либо малой изученностью семейства вообще, либо тем, что белки в семействе сильно различаются.
Неспецифические последовательности показывают, какие еще дополнительные функции мог бы выполнять мой белок, а так же те функции, которые сопутствуют выполнению основной задачи (обратим внимание на большое число сайтов фосфорилирования).

Мотивы в белке CYNS_ECOLI, описанные в БД Prosite

Комментарии: